Музей расположен в квартире внутри Российской академии музыки имени Гнесиных. Здесь последние восемнадцать лет жизни прожила Елена Фабиановна Гнесина (1874-1967) – легендарная фигура в истории российской культуры. В течение 72 лет она возглавляла созданный замечательной семьей Гнесиных, пятью сестрами и братом Михаилом, комплекс музыкальных учебных заведений, носящий их имя.

​

Гнесины всегда жили в том же здании, где находилось их детище. На протяжении почти полувека это был старинный особняк на Собачьей площадке – в одном из самых очаровательных уголков старой Москвы. При строительстве современного здания Института, ныне Академии им. Гнесиных (построено в 1946 г.), в нем была также запланирована квартира, где проживали сестры Елена (директор института) и Ольга Гнесины. В новой квартире Гнесиных все было сделано так, что напоминало их старый дом. Благодаря этому сегодня в музее можно представить себе атмосферу ныне уже не существующей Собачьей площадки (она была разрушена при постройке Нового Арбата). 

После смерти Елены Фабиановны в квартире была сохранена без изменений вся обстановка и в 1969 году создан музей – один из немногих, где мемориальная экспозиция полностью соответствует облику дома при жизни его хозяев. Открытый для посетителей в 1970 году, это – единственный в Москве музей-квартира, расположенный внутри вуза. Создателем музея и его директором на протяжении двадцати пяти лет была М. Э. Риттих. Вплоть до 1990 года музей работал как народный – все его сотрудники, педагоги и воспитанники Гнесинских учебных заведений, трудились исключительно на общественных началах.